以中医为主，中西医结合，科室齐全。其中肿瘤内科、内分泌疾病、红斑狼疮、血液病、糖尿病、心脑血管病、肝病、胃病、肿瘤外科、肝胆外科、乳房病、男性病、前列腺病、泌尿系感染、风湿病、慢性结肠炎、儿童哮喘内病外治、颈椎病推拿、小儿推拿、中风后遗症康复、过敏性鼻炎、中药祛痣、骨关节病、脊柱病、慢性骨髓炎、放射介入治疗、无痛人流等专科专病门诊在同行中享有很高的声誉，深受大家的信赖。

江苏省第二中医院（又名南京中医药大学第二附属医院）于1989年经江苏省人民政府批准创办，是一所融医疗、教学、科研为一体，中医、急诊、西医、中西医结合科室齐全的三级综合性医院。我院开设的西医科室有：内科、外科、骨科、妇科、儿科、皮肤科、耳鼻咽喉科、眼科、口腔科；中医科室有：内科、外科、骨科、妇科、儿科、皮肤科、针灸科、推拿科、肛肠科；急诊系统有内科、外科、骨科、儿科等科室，昼夜对外接诊。还设有肿瘤内科、内分泌疾病、红斑狼疮、血液病、糖尿病、心脑血管病、肝病、胃病、肿瘤外科、肝胆外科、乳房病、男性病、前列腺病、泌尿系感染、风湿病、慢性结肠炎、儿童哮喘内病外治、颈椎病推拿、小儿推拿、中风后遗症康复、过敏性鼻炎、中药祛痣、骨关节病、脊柱病、慢性骨髓炎、放射介入治疗、无痛人流等专科专病门诊。我院专家会诊中心拥有一批临床经验丰富，擅长治疗各种疑难杂症且疗效独特，在省内外享有盛誉的专家、教授及专门人才。住院部核定病床500张。一幢面积30000平方米的现代化病房大楼正在设计施工中。我院除拥有省级医院所具备的常规医疗设备、仪器外，还拥有一批先进的、具有准确诊疗效果的设备、器械，如美国产螺旋CT、日本产数字化胃肠机、进口大型X光机、彩超、电子胃镜、电子肠镜、心电高频信息检测分析仪、进口心电监护仪等高新诊疗设备和器械近百台（件）。

我院为南京中医药大学的附属医院，是大学的核心教学医院，我院的医生大多为大学的兼职教师或为研究生导师。有多项科研项目和发明在国际、国内获奖。