该所是以研究小儿感染性疾病和群体儿童保健为重点的儿科综合性研究所。

　　其前身是中国医学科学院儿科研究所，成立于1958年，是新中国第一家以研究儿童保健、儿科疾病为重点，兼有医疗、教学、预防任务的应用医学研究机构。该所是以研究小儿感染性疾病和群体儿童保健为重点的儿科综合性研究所，在40余年的发展中，已形成了独特的学科优势，是“世界卫生组织卫生合作中心”、“中国儿童卫生保健与疾病防治指导中心”。1983年归属北京市卫生局领导并组建附属儿童医院，1986年附属医院正式开院。1991年、1993年组建了北京市感染与免疫中心实验室和北京市医用生物制品中试基地。中心实验室在应用基础性研究领域中，运用分子生物学研究手段，开展了儿童感染性病原的纵深研究，同时，生物制品中试基地又为研究所的技术成果实现产业化转换，奠定了重要的物质和技术基础。全所有职工900余人，其中专业技术人员占78％，具有高级专业技术职务的有120余人。

　　研究所和附属医院地处朝阳区雅宝路2号，占地面积28000平方米，建筑总面积42510平方米。1990年，在西城区月坛南街1号的研究所原址开设了专家门诊部，建筑总面积3660平方米。

　　儿研所同时也是全国哮喘防治指导中心、中－加儿童健康研究合作中心、北京市感染与免疫中心实验室、北京市医用生物制品中试基地、儿科学硕士学位授权点、儿科学博士学位授权点（与协和医科大学联合）。附属儿童医院是爱婴医院、三级甲等医院、北京大学教学医院、北京高等医学专科学校教学医院。

　　研究所对儿童感染性疾病，在细胞学、病毒学、临床诊断治疗学等方面建立了基础性研究与临床应用紧密结合的完整体系。目前，在儿科感染病原学研究方面已处于全国领先水平。“小儿病毒性心肌炎的研究”获北京市科技进步一等奖、国家科技进步二等奖；“肠道A组轮状病毒的研究”获北京市科技进步一等奖。是全国儿童哮喘协作研究的牵头单位，是中华儿科学会呼吸组的组长单位。

　　研究所为国务院学位委员会批准的儿科硕士、博士学位授权单位。目前所内有国家级突出贡献专家2人，北京市突出贡献专家4人，副高级以上研究人员77人，获博士学位6人，硕士学位46人。

薛沁冰 女 儿科专业，开展城乡儿童保健、小儿传染病疫苗、小儿营养缺乏病、母乳喂养、小儿智能发育等研究
李家宜 女 儿科专业，擅长小儿心血管疾病诊治
方鹤松 男 儿科专业，擅长中西医结合治疗小儿腹泻、厌食、腹痛、咳喘、婴儿肝炎、发热性疾病、儿科疑难病等
吴婉芳 女 儿科专业，擅长新生儿疾病、母乳性黄疸、乳儿肝炎、疑难杂症等诊治
张梓荆 男 儿科专业，擅长小儿呼吸道疾病诊治
叶蓁蓁 女 儿外科专业，擅长小儿先天性畸形诊治
郭行平 女 儿内科专业，擅长小儿心血管疾病诊治，对小儿病毒性心肌炎等诊治，有丰富的临床经验
许克铬 女 儿内科专业，擅长小儿神经系统疾病诊治
马汝柏 女 儿外科专业，擅长先天性消化系统畸形诊治
卢竞 男 儿内科专业，擅长小儿呼吸道疾病急救、临床免疫研究
陈育智 女 儿内科专业，擅长儿童哮喘预防、治疗
李兢 女 儿科专业，擅长小儿心血管疾病诊治
韩秀兰 女 儿科专业，擅长小儿呼吸道疾病诊治